Dr. Theo Yedlin – ein neuer Bewohner von Wayward Pines – erwacht aus der ausgesetzten Animation und findet sich mitten in dieser Rebellion wieder, als er versucht zu verstehen, was Wayward Pines wirklich ist und dazu beitragen, die gefährdete menschliche Rasse zu erhalten. CJ Mitchum, ein ursprünglicher Bewohner von Wayward Pines und Historiker für die Stadt mit umfangreichen Kenntnissen über seine komplexen Ursprünge, ist der einzige, der eine einzigartige Brücke zwischen der gegenwärtigen Welt von Wayward Pines und der früheren Welt, die Menschen bewohnten, bieten kann. Megan Fisher ist verantwortlich für die wissenschaftliche Forschung, die an den Abbies durchgeführt wird, und bleibt tief in die Entwicklung der Herzen und Köpfe der Zukunft der Menschheit involviert – Wayward Pines' "First Generation".