Nachdem viele der X-Men gestorben sind und die Allianz der Kämpfer mit den übernatürlichen Kräften aufgelöst wurde, befindet sich Logan aka Wolverine in einer Situation, in der er von der Verantwortung gegenüber seinem alten Team entbunden ist. Auf der Suche nach einem Grund zu leben, begibt er sich in das moderne Japan. Dort trifft er sowohl ihm gut und schlecht gesonnene Menschen und muss sich fragen, wem er trauen kann. Neben Feinden wie Industriellen, Politikern, Frauen und Ninjas trifft er auch auf seinen Erzfeind: Kenuichio Harada, besser bekannt als Silver Samurai. Als Mutant kann er verschiedene Stoffe mit Energie beladen und so mit seinem Samurai-Stahl jede Materie durchdringen. Wolverine entdeckt zum ersten Mal, dass es etwas gibt, das ihn verwundbar macht und stößt an seine körperlichen und emotionalen Grenzen. In einem seiner schwierigsten Kämpfe stellt er sich seiner eigenen Unsterblichkeit.
A Walk in the Woods — Marco Beltrami & Pete Anthony
Kurz vor dem Anfang geht Logan durch den Wald und trifft auf einen Bären.
Logan's Run — Marco Beltrami & Pete Anthony
Euthanasia — Marco Beltrami & Pete Anthony
Logan ist gezwungen, einem verwundeten Bären Euthanasie zu verabreichen.
Threnody for Nagasaki — Marco Beltrami & Pete Anthony
Two Handed — Marco Beltrami & Pete Anthony
Funeral Fight — Marco Beltrami & Pete Anthony
Die Yakuza versuchen, Mariko bei Yashidas Beerdigung zu entführen.
The Offer — Marco Beltrami & Pete Anthony
Arriving at the Temple — Marco Beltrami & Pete Anthony
Trusting — Marco Beltrami & Pete Anthony
Abduction — Marco Beltrami & Pete Anthony
Mariko wird entführt. Logan kann die Entführung nicht aufhalten, und er trifft Yukio.
The Snare — Marco Beltrami & Pete Anthony
Bullet Train — Marco Beltrami & Pete Anthony
Kantana Surgery — Marco Beltrami & Pete Anthony
Goodbye Mariko — Marco Beltrami & Pete Anthony
Whole Step Haiku — Marco Beltrami & Pete Anthony
Dreams — Marco Beltrami & Pete Anthony
The Wolverine — Marco Beltrami & Pete Anthony
The Hidden Fortress — Marco Beltrami & Pete Anthony
Logan versucht, die Festung zu infiltrieren, um Mariko zu retten.
Ninja Quiet — Marco Beltrami & Pete Anthony
Where to? — Marco Beltrami & Pete Anthony
Logan fährt mit Yukio am Ende in einem Flugzeug ab.
Sword of Vengence — Marco Beltrami & Pete Anthony
Silver Samurai — Marco Beltrami & Pete Anthony